こんにちわ。明日から帰省なので、今日は午前中で作業終了して準備と大掃除に取り組む予定です。 今日中に動画構想を終えたかったんですが、無理でした(-_-) 一応前半部分だけは終わったので、いつも通りgoogle ドキュメントへのリンクを貼り付けます。動画…
8/10 作業ログ次に例として用いるRefseq IDリストの作成。 そもそもRefseqIDには以下の６つがある。（）はBiomartのヒト遺伝子データセットにおけるヒット数 (21560 / 53893) Refseq DNA ID NR_004394 NM_022100 (2142 / 53893) Refseq predicted DNA ID XR_…
４作目のBioProjectの動画も無事に上がり、５作目の動画を考えていたところBiomartのチケットがいっぱいあったのでそれらを作成していくことになりました。 どうやら目的に合わせて細かく作っていく方針らしぃ。 細かくやるならそこまで時間かからなさそうだ…
こんにちわ。明日からは休みですね。 平日最後の金曜日。なんとかBioProjectの動画のupが完了しました!!!NCBI BioProjectの使い方 http://togotv.dbcls.jp/20110805.htmlちょうど2週間ぶりのupでペースとしては早いですが、作業時間は30時間ほどなので普段の…
こんにちわ。今日は5時間作業ぶっ通しました。 その結果無事に動画の構想は終了し、動画撮影後の編集に入っています。 編集作業は今のところ4割方終了し、尺にして残り約3分の編集が残っています。 動画の構想については先日のgoogleドキュメントへのリンク…
こんにちわ。8月も今日で3日目です。 牧場でメロンが食べられました。幸せです(*´∀｀*) 今日は動画の構想を考えると共に、動画の吹き出し文をまとめていました。 いつものように、googleドキュメントへのリンクをベタっと貼り付けます。https://docs.google.…
こんにちわ。今日から8月です。 今月はバイトとOS演習とCELL読むのとテスト勉強と帰省で全てが終わりそうな予感。 夏休みは9月から！！ってことでが、がんばる…(T_T)まずはこの前のまとめの続きを。8/1作業ログ・プロジェクトから貼られているデータのリンク…
今月最後の作業ログとなります。 先日に続いての勤務となりました。 午前中はBioProjectの詳細をh_onoさんにお伝えしたあと、動画作成のGOサインが出ましたので、仕事のチケットを作成して、BioProjectの使い方の調査をしていたのですが… 今月は最後の金曜っ…
次作動画を何にするか悩んで調査をしていたのですが、前回の日記で少し取り上げたBioProject （http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/）が思いの外、使い勝手が良いということがわかったので、どういった部分が利点で、また欠点であるのかを今回の日記に…
お久しぶりです。15日の金曜に風邪で欠勤したため、2週間ぶりの更新です。 ようやく動画の編集も終わり、動画のうｐが完了しました。GOLD -Genomes Online Databaseを使い倒す 2011 http://togotv.dbcls.jp/20110725.html#p017分弱の動画となりました。NCBI…
GOLD動画の編集がはじまっています。 なんというか…まず、GOLDのページの原色の使用率が半端ないｗｗ 吹き出しの色と変に混じって吹き出しの文字が見えにくかったり… 透明度を下げたろうかと思ったけど、吹き出しの色をグレーにすることで解決。 原色使いま…
あと７分で牧場を出て、根津駅にダッシュして柏に行かなければなりません、ハジメです。 時間との戦いです。柏遠いです、交通費高いです、暑いです、つか日記書こう。今日はやっと動画の構想の詳細を詰める作業が終了しました。 NCBIについての扱いなんです…
火曜午前中に来るのが安定してきたハジメです。 今回は動画の構想の詳細を詰める作業をしていました。 詳細は以下のリンクを御覧ください。 https://docs.google.com/document/d/1BUsaTQm-Gdpj8oiQiXv36RI8Fwzwcpv7YOFId4nglfM/edit?hl=jaまだ全部終わってな…
史上最悪な中央線の混雑具合に遭遇し死にかけました。ハジメです。 60分身体を圧迫され続ける感じはもうなんとも地獄…朝しんどいですね(-_-;) そんなわけで３０分遅れという失態。まぁその分３０分長く働きました！！今回でGOLDの大体の調査が終了しました。…
月曜はいろいろしんどくて行けず、今日火曜の午前中に牧場におじゃましています。 ひとまず、今月の出勤表を提出。今月は25h牧場に居たみたいですΣ 25hの働きができているのか…ほとほと疑問ですが、それに見合うよう作成していきたいところ。今日は前回に引…
本日から三作目の動画作成をはじめることになりました。ハジメです。 ネタを探しに統合ｔｖ司令部をチェックしたところ、GOLDの項目の優先度が急ぎになっていたので、この動画をつくることに即決定。 配列解析系のネタが自分は好きなんだなと実感。 優先度が…
ぷはー2作目の動画、UCSC Table Browserを使い倒す 2011 http://togotv.dbcls.jp/20110620.html が完成しました！！今回の動画は作り直しの前半部分と、自分でオリジナルで作った、RefSeqデータをGTFファイルで取得する後半部分の2部構成になっています。 後…
6/12の日曜に、芋けんぴを食べていて奥歯の詰め物がバキっと音を立てて崩壊したんで、次の日は治療のため牧場に行けずじまいでございました。そういうわけで今日6/17にようやく動画の編集作業がスタートしました。 ７分の動画を撮って編集しているのですが、…
6/6，10とかけてUCSC Table browserを使い倒すで紹介されていた内容の勉強と、今回作成する動画の構成を考えていましたが、先ほど動画の構想が完了しました！！ 元となる動画の撮影は終えているので、来週の月曜で動画の編集が終わり、金曜にアップロードま…
今週から本格的に「UCSC Table browserを使ってrefseqのGTFファイルを作成する」の動画を作成することになりました。 そのためにいろいろとお勉強。この時間が一番楽しかったりします。 興味ある分野をバイトとしてやれるのが素晴らしい。 動画の方針として…
五月祭も無事に終了し、ほわほわと動画制作に本腰を入れていきます。ハジメです。 今日は５月までの勤務時間の報告と次の動画のネタ探しをやってました。 ４，５月ではどうやら３３時間ほど牧場に居たとのことで、結構な時間居ったんやなーと実感中。 たくさ…
ご無沙汰しておりました。ハジメです。 GW中牧場が計画的に閉鎖されてたり、生化の実験レポに追われたり、五月祭の企画責任者として仕事をしたりと忙殺されて、牧場に行くペースが落ちていました。 そんな中ようやく初の動画をUPすることができました。Bioma…
4/25、27作業ログ ・バイオマート http://www.biomart.org/index.html ・ensembl http://www.ensembl.org/index.html ・Vega http://vega.sanger.ac.uk/index.html ↑人手で遺伝子配列についてのアノテーションを行ったものをまとめたDB ensembl genes 62のオ…
タイトルに放牧回数書けば、まず数え間違えることはないなと気づいたハジメです。 ちと前回分書き損ねたので2回分同時更新することになります。4度目の放牧では1作目の動画のはてなダイアリーの開設方法を完成させました。 前回の放牧である程度動画編集の方…
いつまで勤務回数を数えられるんでしょうか…こんばんわ。 今日、4/18(月)の15:00から3度目の牧場勤務をしてきました。 今日は作った仮動画のチェックがされる予定でしたが、hな小野さんが不在なため、過去作られた動画を洗いざらい観る3時間となりました。 …
時期が空いてしまいましたが4/15（金）に二度目の牧場だったので、その放牧記を忘れる前に記しておきます。 どこまでくだけた感じにしてしまうか悩ましいところですが、とりあえずは仕事用ということでまともな文章になるように努める所存。 酒飲みなので、…
はじめまして！4/14（木）に初めて統合牧場でRAとして働きました。shell_bisもといハジメといいます。 ツイッターアカウントはshell_bisですが、呼ぶときはハジメと呼んでもらえればと思います。牧場関係者の皆様方、よろしくお願いします。 このブログでは…
