データフォーマット変換中

こんばんわ。

前回の勤務でうーうー悩んでいたのは、GSEAの解説動画発展編を見逃していたのが原因でした(ｵｲ

そんなわけで見逃していたGSEA発展編をみて、ひとまずその通りに解析を実行してうまくいったので、その解析をPANTHERでも行う（昨日のブログの２つ目のオプションで）ことが今日の目標となりました。

PANTHERで解析を行うには遺伝子のIDと発現量の数値をセットにしたデータセットを用意しなければなりませんが、マイクロアレイのprobeIDは適用できません…

そんなわけでまずはIDの変換を行うことからはじまり、次にDAVIDで使われたリストのものに限定する作業（例として使われるデータをツール間で揃えるため）を行なっています。

ツールに応じて必要なデータやフォーマットが異なるのでそれを調整するのは結構面倒で時間を食ってしまっています。

次回勤務はまとまった時間を取って一気に調査を終えたいと思います。

次回ブログにはまとめたデータセット等もうｐする予定です。