2012-01-01から1年間の記事一覧
久方ぶりの更新です。3月は家でゴタゴタあったりなどしてほとんど勤務できていませんでした。身の振り方等々考える必要がありそうです。まぁそれは置いといて久々の勤務ですが、今はPANTHERの動画構想を練っているところです。まずはいつも通り動画構想のド…
こんにちわ。今回の勤務でデータフォーマットの変換を終えました。そして変換したデータをいろんな条件の元でPANTHERに投げ、表示された結果を条件間、ツール間(GSEAやDAVID)で比較しPANTHERはどういったところがいいかをまとめる作業を始めています。以下…
こんばんわ。前回の勤務でうーうー悩んでいたのは、GSEAの解説動画発展編を見逃していたのが原因でした(オイそんなわけで見逃していたGSEA発展編をみて、ひとまずその通りに解析を実行してうまくいったので、その解析をPANTHERでも行う(昨日のブログの2つ目…
こんにちわ。前回に引き続いてPANTHERの調査を行なっています。PANTHERの発現解析ツールとしての側面を調べる方向で、ひとまずすでに動画として紹介されているDAVIDとGSEAの使い方を勉強。その後、そこで使ったデータセットをPANTHERでも使ってみることにし…
今回の勤務からPANTHERの調査を行いました。調査ログをgoogle documentに残したので、以下貼り付けPANTHER 調査ログ正式名称 The PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships) Classification System http://www.pantherdb.org/PANTHER i…
こんばんわ。今日から新しい動画作成に向けたネタ探しを行なっています。チケット117番のPANTHER http://www.pantherdb.org/ とか面白そうです。これの調査に入る前に…ちと何日か前にDDBJ版のBioProjectのtweetを見かけたので、そろそろ紹介時なのか?多分そ…
こんにちわ。今月3度目の勤務となりました。先月、今月と勤務時間が短いですが、来月からはもうちょい勤務ペースを増やせるかと思います。今日の勤務ではBioMart v0.8の動画のupを音声付きで行いました。(月末掃除もしたよ)今まで音声が無かったので、音…
こんにちわ。今日は東京に大雪注意報が出る珍しい一日です。そんな中新年になって2度目の放牧でした。前回の勤務で3分ほどの動画編集が終わっていたのですが、今回で無事に全編集が終わりました。888888888動画時間はちょっと短くなって6分ほど。BioMart初心…
あけましておめでとうございます。今日が新年なって最初の勤務となりました。今年もまたよろしくお願い申し上げます。今日は前回の動画編集の続きを行いました。動画ファイル7分のうちちょうど半分の3分半まで編集が終わりました。今回はちと動画編集に思っ…