６、７度目の放牧 - shell

4/25、27作業ログ
・バイオマート
http://www.biomart.org/index.html
・ensembl
http://www.ensembl.org/index.html
・Vega
http://vega.sanger.ac.uk/index.html
↑人手で遺伝子配列についてのアノテーションを行ったものをまとめたDB
ensembl　genes 62のオプションとして選べるのであまり使わない。

Vertebrate：脊椎動物の
annotation：情報付与
・reactome
http://www.reactome.org/ReactomeGWT/entrypoint.html
・PRoteomics IDEntifications database (PRIDE)
http://www.ebi.ac.uk/pride/
・WORMBASE 220
↑ the database of the model organism Caenorhabditis elegans and related nematodes.
http://wiki.wormbase.org/index.php/Main_Page

・把握オプション
Features
Structures
Transcript
Sequences
・未把握オプション
Homologs
Variation

今週は作り直す動画内で使われてるオプションの把握が主でした。
残りは上のように進化生物学とか遺伝学とか…生物の知識をなんとかせないかんことが判明。
GW中は独学で知識を吸収していく予定。
問題はOS演習の課題とか実験のレポートとかも処理せないかんという…
同時にこなせるのだろうかーー；